A anaplasmose bovina é uma doença hemolítica causada pela Rickettsia Anaplasma marginale, parasita intraeritrocitário obrigatório que acomete ruminantes. Pode ser transmitida biologicamente pelo Rhipicephalus microplus, popularmente conhecido como carrapato-do-boi ou por transmissão mecânica por meio de insetos hematófagos e fômites. A anaplasmose causa perdas econômicas consideráveis na pecuária, principalmente por causar alta morbidade e mortalidade. Em decorrência do clima propício para presença de R. microplus, que é o principal transmissor desta doença, o Brasil é considerado como área endêmica para a anaplasmose, ocorrendo em praticamente todo o território. Os animais acometidos por esta patologia apresentam inicialmente aumento de temperatura corporal e anemia, caso não ocorra tratamento imediato, a doença tende a evoluir para sintomatologia clinica severa e culminar no óbito ou tornar-se crônica. Estudos mostram que os bovinos com composição genética taurina são mais susceptíveis a infestações por R. microplus e consequentemente, apresentam maior frequência de infecção por A. marginale quando comparados a bovinos de composição genética zebuína. O diagnóstico de anaplasmose é difícil, pois dependendo da fase de desenvolvimento da doença pode não apresentar Rickettsemia suficiente para observação no esfregaço sanguíneo. Na maioria das vezes, todo o rebanho é acometido pela A. marginale, portanto, o qPCR tem sido muito utilizado para estudos desta doença, principalmente pela alta sensibilidade da técnica que possibilita obter resultados quantitativos e qualitativos.